随着系列的开始，彼得帕克已经成为蜘蛛侠一年了。他拯救了生命并与超级恶棍作战，但他仍在学习如何成为超级英雄。神盾局的尼克弗瑞让彼得有机会训练成为真正的超级英雄并成为“终极蜘蛛侠”。然而，彼得首先必须学习如何与一个由四位青少年超级英雄组成的团队合作：Nova、White Tiger、Iron Fist 和 Power Man。在这个赛季中，腐败的实业家诺曼·奥斯本在暗中瞄准了蜘蛛侠，希望收集他的 DNA 来组建一支蜘蛛兵军队，然后卖给政府。为此，他使用章鱼博士作为他的棋子，让他派出许多超级恶棍追捕蜘蛛侠，并使用蜘蛛侠的血液样本制造毒液共生体，最终与诺曼的哈利·奥斯本建立了联系。的儿子和彼得最好的朋友。在两集的最后一季中，蜘蛛侠得知诺曼是章鱼博士的计划和毒液创造的幕后黑手，正好赶上章鱼博士报复诺曼，因为他对待诺曼的方式是让他变本加厉。进入绿魔。
